一般炎性腸病患者會表現為反復的腹痛、腹瀉、粘液血便，甚至出現各種全身并發癥如視物模糊、關節疼痛、皮疹等。本病經治療可好轉，也可自行緩解。但多數患者反復發作，遷延不愈，其中相當部分患者因出現并發癥而需要手術治療。
