遺傳毒性：瑞芬太尼的原核細胞基因突變試驗、大鼠肝細胞程序外DNA合成試驗（UDS）、基因斷裂試驗（CHO細胞）和小鼠微核試驗的結果均為陰性；但有代謝活化劑存在，體外小鼠淋巴細胞試驗出現致突變作用。
生殖毒性：
①一般生殖毒性：瑞芬太尼0.5mg/kg（按體表面積mg/m2計算，相當于臨床最大推薦人用劑量的40倍）連續靜脈注射70多天，雄性大鼠的生育力降低；雌性大鼠交配前靜脈注射瑞芬太尼1mg/kg15天，其生育力未受影響。
②致畸敏感期毒性；大鼠和家兔分別靜脈注射瑞芬太尼5mg/kg和0.8mg/kg（按體表面積mg/m2計算，相當于臨床最大推薦人用劑量的400倍和125倍）未見致畸作用。懷孕兔和大鼠注射放射性標記的瑞芬太尼后，發現其通過胎盤并進入胎仔體內。
③圍產期毒性：大鼠圍產期靜脈注射瑞芬太尼5mg/kg（按體表面積mg/m2計算，相當于臨床最大推薦人用劑量的400倍），對F1代大鼠的存活、發育和生殖能力未見明顯影響。其它：甘氨酸(靜脈注射劑的常用輔料)為本品的輔料。犬鞘內注射無瑞芬太尼的甘氨酸后，出現興奮激動、疼痛、后肢功能失常、共濟失調，因此可認為此作用為甘氨酸所致；但上述動物表現與本品制劑靜脈注射給藥無關。