幾乎所有的真核生物的 mRNA都有一個5′帽端，但并不是所有基因的mRNA都有3′多聚A尾部，也不是所有基因的mRNA都必須經過拼接。根據這后兩種加工過程的有無和復雜程度，可將真核基因的轉錄單位分為兩大類型：一類是簡單的只編碼產生一種蛋白質的基因，另一類是復雜的編碼兩種或更多種蛋白質的轉錄單位。在3′端加尾部位或拼接部位上的變化都會使同一基因最終形成不同的蛋白質產物。圖2a是表示多聚 A加尾部位不同而使基因終產物不同的模式，屬于這種情況的有腺病毒的晚期基因、小鼠免疫球蛋白的重鏈基因和一種多肽激素降血鈣素基因。圖2b是表示拼接部位不同而使基因終末產物不同的模式，迄今為止僅在哺乳動物細胞的病毒（如腺病毒、SV40病毒、多瘤病毒和反轉錄病毒等）中發現有這種形式的加工調控。