真菌感染（fungal infection）：對人類有致病性的真菌約有300多個種類。除新型隱球菌和蕈外，醫學上有意義的致病性真菌幾乎都是霉菌。根據侵犯人體部位的不同，臨床上將致病真菌分為淺部真菌和深部真菌。真菌性腸炎即屬于深部真菌病。淺部真菌(癬菌)僅侵犯皮膚、毛發和指(趾)甲，而深部真菌能侵犯人體皮膚、黏膜、深部組織和內臟，甚至引起全身播散性感染。深部真菌感染腸道即表現為真菌性腸炎，可獨立存在如嬰兒念珠菌腸炎，或為全身性真菌感染的表現之一，如艾滋病并發播散性組織胞漿菌病。
