1.對其他顛茄生物堿不耐受者，對本品也不耐受。
2.孕婦靜脈注射阿托品可使胎兒心動過速。
3.本品可分泌入乳汁，并有抑制泌乳作用。
4.嬰幼兒對本品的毒性反應極有敏感，特別是痙攣性麻痹與腦損傷的小兒，反應更強，環境溫度較高時，因閉汗有體溫急驟升高的危險，應用時要嚴密觀察。
5.老年人容易發生抗M膽堿樣副作用，如排尿困難、便秘、口干（特別是男性），也易誘發未經診斷的青光眼，一經發現，應即停藥。本品對老年人尤易致汗液分泌減少，影響散熱，故夏天慎用。
6.下列情況應慎用：
①腦損害，尤其是兒童；
②心臟病，特別是心律失常，充血性心力衰竭、冠心病、二尖瓣狹窄等；
③反流性食管炎、食管與胃的運動減弱、下食管擴約肌松弛，可使胃排空延遲，從而促成胃潴留，并增加胃-食管的反流；
④青光眼患者禁用，20歲以上患者存在潛隱性青光眼時，有誘發的危險；
⑤潰瘍性結腸炎，用量大時腸能動度降低，可導致麻痹性腸梗阻，并可誘發加重中毒性巨結腸癥；
⑥前列腺肥大引起的尿路感染（膀胱張力減低）及尿路阻塞性疾病，可導致完全性尿潴留。
7.對診斷的干擾：酚磺酞試驗時可減少酚磺酞的排出量。