治療原則以病因和對癥治療并重。由于精神障礙往往會影響軀體疾病的嚴重度和治療，精神障礙的對癥治療也是一種必要的應急措施。
病因治療
積極治療原發軀體疾病，以激素治療為主，停藥后易復發，需要鞏固過程，免疫抑制劑的應用。在大多數病例中在采取相應的病因療法后精神障礙可得到緩解。
對癥治療
精神障礙以對癥為主，意識障礙時要盡量避免用抗精神病藥藥，抑郁、焦慮時可用抗抑郁藥、抗焦慮藥。由于精神障礙的存在會影響軀體疾病的治療，軀體疾病的改善也需要有個過程，故在治療開始須同時應用相應精神藥物以對癥治療是十分必要的。精神藥物治療原則與功能性精神疾病不同，①劑量宜小；②充分考慮藥物的副反應和禁忌證，選用同類藥品中副反應較少者；③精神癥狀緩解后即應停藥。
支持療法
如以意識障礙為主，則需同時施行支持療法，包括能量供給，維持水、電解質平衡和維生素的補充。
心理治療
在進行藥物治療的同時，不應忽視心理治療。如支持性心理治療，即針對患者的病情和顧慮進行耐心解釋，勸慰和鼓勵，以消除患者的緊張、恐懼和疑慮。要對患者體貼和照顧，建立融洽的醫患關系，以保障治療的順利進行。認知療法，即加強病人對自己疾病的認識，消除不適當的猜測，樹立信心，積極配合各項治療計劃。
護理
安靜的環境和良好的護理是非常重要的。特別是當病人有意識障礙出現恐怖性幻覺或不協調性精神運動性興奮時，更應加強護理，以防自傷、摔倒、沖動和發生意外。對有抑郁心境的病人，應提高警惕，加強防范，防止自殺。在護理過程中要注意態度和藹、言語溫和、動作輕柔，避免較強的不適刺激。