根據耐藥種類分為以下四種：
1、單耐藥：結核病患者感染的結核桿菌體外被證實對一種一線藥物抗結核藥物耐藥。
2、多耐藥：結核病患者感染的結核桿菌體外被證實對不同時包括異煙肼、利福平在內的一種以上的一線抗結核藥物耐藥。
3、耐多藥（MDR－TB）：結核病患者感染的結核桿菌體外被證實至少對異煙肼、利福平耐藥。
4、廣泛耐多藥（XDR－TB）：結核病患者感染的結核桿菌體外被證實除了至少對兩種主要一線抗結核藥物異煙肼、利福平耐藥外，還對任何氟喹諾酮類抗生素（如：氧氟沙星）產生耐藥，以及三種二線抗結核注射藥物（如：卷曲霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素等）中的至少一種耐藥。
根據病人是否接受過抗結核藥物治療以及耐抗結核藥物的種數耐藥結核病可分為：原發性耐藥、初始耐藥、獲得性耐藥、耐多藥結核。
1、原發性耐藥結核：指沒有接受過抗結核藥物治療而發生結核桿菌耐藥。
2、初始耐藥結核：指經臨床評估后，不能充分肯定以往沒有接受過抗結核藥物治療)或治療小于1個月而發生的結核桿菌耐藥。包括原發性耐藥和末發現的獲得性耐藥。
3、獲得性耐藥結核：指接受過抗結核藥物治療時間大于1個月而發生的結核桿菌耐藥。
4、耐多藥結核(MDR-TB)：指至少同時耐利福平和異煙肼的結核病人。