部分肝炎病毒感染者可有風濕免疫病的表現,如關節痛和(或)關節炎、皮疹等,部分患者可檢測出自身抗體,如類風濕因子(RF)、抗核抗體、抗平滑肌抗體、冷球蛋白、抗甲狀腺過氧化物酶抗體等。自身抗體的產生與肝炎病毒感染B淋巴細胞及分子模擬機制有關,自身免疫反應與疾病的嚴重程度、病程長短有關。