多數患者病因不明。肝中靜脈或肝靜脈主干阻塞多源于血栓和膜性狹窄性疾病,如真性紅細胞增多癥、妊娠晚期、圍術期血液高凝狀態、腫瘤、放射病、創傷、炎癥性腸病及結締組織病等;肝小靜脈閉塞多與誤食含吡咯烷生物堿的植物有關,亦與大量應用化療藥物、骨髓移植等相關。