有一類化學結構屬于多肽或蛋白質的激素，如下丘腦、垂體、胰島、胸腺等分泌的激素；這類激素含量增高或不足時將導致一些重要疾病，如常見的胰島素不足引起的1型糖尿病。垂體生長激素不足造成侏儒癥，生長激素過多引起的巨人癥或肢端肥大癥等。
促甲狀腺素釋放激素：自下丘腦分離提純，僅由焦谷氨酸、組氨酸和脯氨酸組成的三肽，具有刺激垂體釋放促甲狀腺激素作用，此外，還可刺激腺垂體釋放催乳素，促進腦內兒茶酚胺的代謝等。
生長抑素：廣泛存在于大腦和胃腸道，為14個氨基酸殘基組成的環肽。對垂體產生的一些激素具有抑制作用。此外，還可抑制胃腸道的內、外分泌，減少胃酸、胃蛋白酶的釋放及胰液分泌，降低胃腸蠕動及膽囊收縮，減少門靜脈血流速度，也是胃出血保守治療的重要藥物。
屬于肽類的其他激素還有胰島分泌的胰島素、胸腺分泌的胸腺素等。