腦膜炎球菌（meningococcus）的學名是腦膜炎奈瑟氏球菌(n.meninyitidis)，為流行性腦脊髓膜炎（流腦）的病原菌。革蘭氏陰性雙球菌，在急性期或早期患者腦脊髓液中，大多位于中性粒細胞內，呈腎形成雙排列，凹面相對。
電鏡下可以觀察到自病人分離的毒性菌株有微莢膜和菌毛。
