腦膜炎及急性腦膜炎球菌菌血癥：凡在流行季節有突然高熱、頭痛、嘔吐伴神志改變，體檢有皮膚粘膜瘀點，腦膜刺激癥狀，臨床診斷可初步成立，血液、腦脊液發現有腦膜炎球菌即可確診。
實驗室檢查：血象白細胞總數及中性粒細胞數皆增高。腦脊液壓力增高，渾濁，呈米湯樣或膿樣，細胞數增多，多為中性粒細胞，糖和氯化物減少，蛋白質顯著增加。瘀點涂片、腦脊液涂片或培養、血培養均可找到腦膜炎雙球菌。
慢性腦膜炎球菌性菌血癥：可根據間歇性發熱、發疹、關節痛及血培養等，進行診斷，但必須與急性風濕熱、過敏性紫癜、亞急性細菌性心內膜炎、鼠咬熱以及多形紅斑等疾病進行鑒別。