血腦屏障的顯微結構已如上述，包括無孔或少孔的內皮細胞、連續的基底膜和有疏松連結的星形膠質細胞血管周足組成的斷續膜，它們構成血腦屏障控制血漿各種溶質選擇性的通透，有的學者把它叫關門或安全瓣，把有害物質拒之腦組織之外使它不能逸出腦毛細血管，比較形象地說明了血腦屏障的正常功能。但是三種成分在完成正常功能時哪個起主要作用則有不同觀點。日本藥理學家中井健五認為：“屏障中起主要作用的是星形膠質細胞，內皮細胞在一定程度上也起重要作用”。按顯微結構來看，腦毛細血管周足包圍血管面積不過85%左右，還有相當大裸露部分可供有害物質的滲出，顯然這種說法是有缺陷的。