1.重癥真菌性角膜炎
特別是鐮刀菌性角膜炎，由于發病急驟，常合并有前房積膿及角膜穿孔，經常被誤診為銅綠假單胞菌性角膜潰瘍，主要鑒別是前者具有典型的菌絲苔被病灶，后者潰瘍呈淡綠色，表面濕潤而有光澤，邊緣光滑，與正常角膜之間有浸潤水腫區。此外，本病與單純皰疹病毒引起的壞死性角膜炎（necrotickeratitis）和棘阿米巴性角膜炎晚期盤狀基質膿腫的臨床表現非常酷似，可以通過病史及實驗室診斷加以鑒別。
2.細菌性角膜炎
細菌性角膜炎是因細菌感染而引起的角膜炎癥，發病前多有角膜外傷史。臨床分為單純性角膜潰瘍和匐行性角膜潰瘍及綠膿性角膜潰瘍三類。
3.病毒性角膜炎
病毒性角膜炎是受病毒致病原感染角膜而引起的炎癥。該病常有明顯的刺激癥狀，有畏光、流淚、酸痛等。病毒性角膜炎，病程較長，愈后且易復發。常可伴有葡萄膜反應，甚至出現虹膜睫狀體炎、前房積膿，或繼發青光眼，是臨床上較為常見的致盲眼病之一。