大環內酯類楊橋等分離得到1株解淀粉芽孢桿菌，對其產生的活性物質經分離純化及化學結構解析，確定其主要成分為大環內酯類抗生素家族(mcro-lactin)的一個新成員，與該家族中最早發現的成員macrolactinA相比，其12位碳上的氫原子被第4個羥基取代，對大腸桿菌、金黃色葡萄球菌均有抑制效果。
寡肽酶Chao等報道了解淀粉芽孢桿菌23-7A產生的一種新型寡肽酶，其氨基酸序列與酶活性和細菌PepFs(金屬肽酶M3系列)類似。
肽類王英國等從堆肥中分離到1株對尖孢鐮刀菌等病原真菌具有強烈抗性的解淀粉芽孢桿菌菌株，將其發酵液分離純化得到一種抗真菌活性物質，通過紅外和質譜方法分析推測該物質為肽類，分子質量為1498u，具有很好的水溶性，并且含有甲硫氨酸。
聚酮化合物Arguelles-Arias等分析了解淀粉芽孢桿菌GA1基因組序列，發現開放閱讀框(ORFs)中的8個基因簇參與聚酮化合物的合成，與Chen等發現的解淀粉芽孢桿菌FZB42有關合成聚酮化合物的基因mln、bae及dfn序列一致。