1.艾滋病
（1）免疫功能檢查：CD4+T淋巴細胞耗竭，外周血淋巴細胞顯著減少，CD4+T淋巴細胞<200/μl，CD4/CD8<1.0（正常為1.25～2.10），遲發型超敏反應皮試陰性，有絲分裂原刺激反應低下，自然殺傷細胞（NK細胞）活性下降。
（2）人類免疫缺陷病毒抗體檢測：采用酶聯免疫吸附試驗（ELISA）、明膠凝集試驗、免疫熒光檢測、免疫印跡檢測、放射免疫沉淀法等，其中前三項常用于篩選試驗，后二者用于確證試驗。
（3）人類免疫缺陷病毒抗原檢測：采用酶聯免疫吸附試驗測定血清中人類免疫缺陷病毒P24抗原，能幫助判斷病毒復制水平，對“窗口期”人類免疫缺陷病毒感染者早期確診有臨床意義。
（4）人類免疫缺陷病毒病毒定量檢測：包括血漿或淋巴細胞病毒培養定量檢測、血漿病毒RNA定量檢測（又稱血漿病毒載量）和淋巴細胞內cDNA定量檢測。其中血漿病毒RNA定量檢測敏感、準確，是最常用的方法。
2.乙型病毒性肝炎
（1）乙型肝炎病毒（HBV）標志物檢測：①乙型肝炎病毒表面抗原（HBsAg）和乙型肝炎病毒表面抗體（HBsAb）的檢測；②乙型肝炎病毒核心抗原（HBcAg）和乙型肝炎病毒核心抗體（HBcAb）的檢測；③乙型肝炎病毒e抗原（HBeAg）和乙型肝炎病毒e抗體（HBeAb）的檢測。
（2）乙型肝炎病毒DNA（HBV DNA）檢測：血清HBV DNA是乙型肝炎病毒復制和傳染的直接證據。
3.丙型病毒性肝炎
（1）抗丙型肝炎病毒（HCV）抗體檢測：丙型肝炎病毒感染后，機體可產生相應的抗體，最早出現的抗體是針對病毒核心殼區C22蛋白的抗體（抗C22抗體），隨后是針對NS3區C33蛋白抗體（抗C33抗體）的產生，該抗體滴度低于抗C22抗體，但高于最后出現的抗C100抗體。
（2）丙型肝炎病毒RNA（HCV RNA）檢測：感染丙型肝炎病毒幾天內，即在谷丙轉氨酶（ALT）升高及抗丙型肝炎病毒抗體出現前幾周，即可測出HCV RNA，因此HCV RNA可作為丙型肝炎病毒感染的早期診斷指標，也可作為丙型肝炎病毒復制、轉歸及有無傳染性的指標。