顱底凹陷癥（basilar invagination）是枕骨大孔周圍的顱底骨向上陷入顱腔，迫使其下方的寰樞椎（齒狀突）升高進入顱底，可合并部位的其他骨發育異常（如椎體分節障礙、寰椎融合障礙），并可合并神經結構畸形（如Chiari畸形、小腦扁桃體下疝和脊髓積水等），這些畸形可見于30%的顱底凹陷患者。
