食欲肽被認為跟失眠有密切的關系。
食欲肽在參與睡眠的調節中扮演重要的角色，在老鼠身內，食欲肽的調節障礙將會繼而導致嗜眠癥（一種睡眠失調癥）。 嗜眠發作會導致早上過多的想睡感覺、無法集中精神以及猝倒。在犬只中，缺乏正常的食欲肽受體將會導致嗜眠發作，另一方面，動物及人缺乏食欲肽亦會導致嗜眠發作。食欲肽會高度刺激跟覺醒狀態有關的腦核及其相關的神經遞質系統（例如包括多巴胺、去甲腎上腺素、抗組胺藥及乙酰膽堿）。
最近的研究指出食欲肽的主要角色是衡量新陳化謝、生理節奏以及睡眠債等多方面的影響從而決定生物體究竟應該清醒或是睡眠。對中央神經系統注射食欲肽會促進或導致失眠、體溫上升、身體運動及能量消費的大幅提升。缺失睡眠亦會增加食欲肽的傳送。可能有人會認為食欲肽是一種刺激食欲的神經肽，但事實上，食欲肽不足的嗜眠發作患者會有體重增加的現象，而不是BMI的下降。另一個關于食欲肽不足會導致嗜眠發作的跡象是，當猴子連續沒有睡眠三十至三十六小時之后，對他們注射一些食欲肽，它們能在長期沒有睡眠的情況之下仍然保持警覺。