原發性腹膜炎大多數是因為身體其他部位病灶的細菌通過血液循環進入腹腔,少數患兒也可通過淋巴系統、胃腸道和女性生殖器(在青春前期局部pH值和黏膜適合于細菌生長)上行進入腹腔而感染。腎病、肝病患兒腹腔內大量腹水,常因其免疫功能低下,補體缺乏而發生腹膜腔的感染。本病最多見的致病菌是A組鏈球菌、肺炎雙球菌、腸球菌、葡萄球菌及大腸埃希菌。