兼性厭氧菌（facultative anaerobe）又稱兼嫌氣性微生物，兼嫌氣菌、兼性好氧菌。在有氧或無氧環境中均能生長繁殖的微生物。可在有氧（O2）或缺氧條件下，可通過不同的氧化方式獲得能量，兼有有氧呼吸和無氧發酵兩種功能。如酵母菌在有氧環境中進行有氧呼吸，在缺氧條件下發酵葡萄糖生成酒精和二氧化碳。
