診斷的主要根據是：
①臨床表現。
②化驗資料。如生化改變、激素水平、免疫學和遺傳學的檢查。
③腺體功能試驗。包括興奮試驗、抑制試驗、激發試驗和拮抗試驗等。這些試驗不僅可判斷內分泌的功能異常，有些還可幫助判斷病變的部位和病因，如促甲狀腺激素釋放激素 (TRH)興奮試驗可幫助鑒別甲狀腺功能減退癥的病變部位在下丘腦、垂體抑或甲狀腺。大劑量地塞米松抑制試驗可幫助鑒別腎上腺病變系增生抑或腫瘤的可能性。
④影像學檢查。有 X射線檢查、放射性核素掃描、電子計算機X射線斷層成像(CT)、B型超聲波檢查、磁共振成像(MRI)等,對病變的定位和確定病因十分有意義。
⑤病理檢查。