進行環境質量監測的第一步工作是制訂監測方案，能不能從監測結果中準確地獲取關于環境質量的信息，除了農業環境監測站等儀器設備的先進程度和所處的工作狀態外更重要的是取決于監測方案得當與否完整的監測方案主要包括以下內容:監測項目、監測范圍、監測周期和監測點位。
土壤環境監測通常分析土壤中重金屬元素、微量元素、農藥和其他污染物質。因土壤性質本身在空間分布上不均，因此，各采樣單元是由幾個不同的樣品}T過均勻混合后所得。采樣點的設置也要盡可能照顧到土壤的全面情況，不能過于集中。采樣布點通常采用網格布點、對角線布點、梅花形布點、棋盤式和蛇形布點等多種 方法。采樣時間根據測定目的確定，為了解土壤污染狀'"R應隨時采集土樣測定也要同時了解在土壤上生長的作物的污染狀況，要在植物收獲季節同時采集土壤和植物的樣品。
農業環境監測站與生物生物監測對比發現，利用指示植物監測大氣污染是一種有效的 方法。大氣污染對敏感指示植物導致的傷害顯而易見。通過大量試驗，編制出植物污染癥狀檢索表和污染損害原色圖譜.可按生物污染受害的可見癥狀，來分析環境 污染的危害程度在農業環境監測的三種方法中，生物監測的靈敏度和可靠性不及理化分析方法，因此，它不能替代常規方法只能作一種補充。
