葉綠素含量與植被的氮素狀況、發育階段及光合能力等方面具有良好的相關性，它往往是植被衰老階段、氮素脅迫的指示。因此利用冠層葉綠素測定儀進行水稻葉片和冠層尺度的葉綠素含量估算，對現代農業技術的發展有重要意義。
冠層葉綠素測定儀可實時輸出作物葉綠素、氮素、水分含量的診斷結果，主要應用于大田作物長勢監測、設施作物養分實時診斷、高光效育種材料篩選、農產品/食品快速檢測等。
根是植物生長發育的基礎，其長短和多少直接影響植物的生長發育，同時也是衡量植物產量的重要指標。在水稻的生產過程中，利于冠層葉綠素測定儀研究水稻葉綠素含量與發根率的關系，可以為為水稻根系的研究提供科學的理論依據。測定方法為，將5個不同品種水稻秧苗在剪根條件下當日移栽，用冠層葉綠素測定儀測定其葉綠素相對含量，移栽5d后測定其根數和根長。
冠層葉綠素測定儀的測定結果表明：不同品種的水稻葉綠素含量越高，其植株所發的根越多越長，并且植株干重越大。D優527和B優827岡優827 相比較，葉綠素含量的差異達0.05 顯著水平。D優527和紅優527、B優827、岡優827相比較，根的數量差異達0.05 顯著水平。同一品種水稻的葉綠素含量與其所發根的數量和長度具有高度的相關性，不同品種的葉綠素含量和其所發根的數量和長度成正比。由此也可以得出結論，水稻葉綠素含量越高，其所發出的根越多越長。
