減數分裂是遺傳學的基礎。具體表現在：
1．在減數分裂過程中，因為同源染色體分離，分別進入不同的子細胞，故在子細胞中只具有每對同源染色體中的一條染色體。減數分裂中同源染色體的分離，正是基因分離律的細胞學基礎。
2．同源染色體聯會時及四分體時期，非姐妹染色單體之間對稱的位置上可能發生片段交換，也就是父源和母源染色體之間發生遺傳物質的交換。這種交換可使染色體上連鎖在一起的基因發生重組，這就是染色體上基因的連鎖和交換定律的細胞學基礎。
由于減數分裂，使每種生物代代都能夠保持二倍體的染色體數目。在減數分裂過程中非同源染色體重新組合，同源染色體間發生部分交換，結果使配子的遺傳基礎多樣化，使后代對環境條件的變化有更大的適應性。
1．保證了有性生殖生物個體世代之間染色體數目的穩定性通過減數分裂導致了性細胞（配子）的染色體數目減半，即由體細胞的2n條染色體變為n條染色體的雌雄配子，再經過兩性配子結合，合子的染色體數目又重新恢復到親本的2n水平，使有性生殖的后代始終保持親本固有的染色體數目，保證了遺傳物質的相對穩定。
2．為有性生殖過程中創造變異提供了遺傳的物質基礎：
1．通過非同源染色體的隨機組合；各對非同源染色體之間以自由組合進入配子，形成的配子可產生多種多樣的遺傳組合，雌雄配子結合后就可出現多種多樣的變異個體，使物種得以繁衍和進化，為自然選擇提供豐富的材料。
2．通過非姐妹染色單體片段的交換：在減數分裂的粗線期，由于非姐妹染色單體上對應片段可能發生交換，使同源染色體上的遺傳物質發生重組，形成不同于親代的遺傳變異。