以淀粉膠、瓊脂或瓊脂糖凝膠、聚丙烯酰胺凝膠等作為支持介質的區帶電泳法稱為凝膠電泳。
聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)除了濃縮效應、電荷效應外,還包括分子篩效應,普遍用于分離蛋白質及較小分子核酸。
瓊脂糖凝膠電泳適用于分離同工酶及其亞型、大分子核酸等。