色譜柱使用pH范圍在1.5～10.0，通常建議使用范圍pH為2.0～8.0比較合適，流動相超出pH范圍將會導致硅膠基質流失和鍵合相斷裂使柱效下降，使用壽命變短，所以要嚴格控制pH范圍。
新的色譜柱活化：采用100%甲醇1ml/min沖洗60min，再換成流動相進行平衡；如果流動相中含有緩沖鹽，在換成流動相前，請使用過渡流動相過渡后再換流動相平衡；
一、日常維護
1、建議檢測前樣品和流動相進行過濾；
2、建議每天做完樣品后及時進行清洗；
3、常規檢測
測試完后，直接把色譜柱反向連接采用90%有機相沖洗45min，最后保存在純甲醇或純乙腈中；
4、使用緩沖鹽條件：
1）等度條件：使用緩沖鹽之前和之后都用過渡流動相以1ml/min流速沖洗45min；
2）梯度條件：使用緩沖鹽之前與初始流動相組成相同的過渡流動相以1ml/min流速沖洗45min；
注意：過渡流動相是指有機相和水相比例與分析流動相相同比例，只是不含有緩沖鹽；
3）緩沖鹽沖洗干凈后，采用90%有機相反向沖洗60min，最后保存在純有機溶劑中；
注意：如果使用緩沖液不能存留色譜柱中過夜；
二、色譜柱的保存
1.短時間內色譜柱的保存
如果使用時間間隔不超過四天，則色譜柱無需特別的維護，只需根據最后一次測試使用的流動相或樣品的性質，在使用后用純甲醇、純水或甲醇與水的混合溶液進行淋洗，直至基線走平約半小時即可。
2.長時間色譜柱的保存
如色譜柱長時間不用，則將其從HPLC儀中取下保存，取下前用合適的溶劑淋洗，洗去不適與保存色譜柱的洗脫液，如C18反相柱可以用純甲醇或乙腈作為保存的介質，然后用塑料塞頭將其塞緊，以免色譜柱內完全干燥。