分子蒸餾技術運用較多的是醫藥、食品、香料等領域，但沒想到它對煙草的生產也起到了至關重要的作用。
在煙草的采收和生產過程中，勢必會有一定量的廢次煙末是不能用的，如果直接舍棄的話不僅是一種浪費，也會給環境帶來嚴重污染。這就需要有一項技術能夠實現對廢次煙末的提取，使得材料得到充分利用。
而這里所涉及到的就是分子蒸餾技術，利用它對廢棄煙末中的超臨界CO2提取物進行精制，由于這一方式具有高純度、全天然、無溶劑殘留和無污染等特點，因此已經被廣泛應用。
在高真空度的條件下，利用不同沸點的物質的分子平均自由程的差異這一特性，實現對產品的連續蒸餾和分離。整個過程避免了物料受熱分解的可能性，同時不需要加入任何溶劑就能夠分離出所需的成分。
然后，如果能將分子蒸餾后的80℃輕組分與120℃輕組分按照一定的比例調配后，會產生好的感官效果。
由此可見，分子蒸餾能夠有效去除超提物中刺激性的雜氣，減少其粗糙、干燥感。
分子蒸餾過程可發如下四步：
1、分子從液相主體向蒸發表面擴散：
通常，液相中的擴散速度是控制分子蒸餾速度的主要因素，所以應盡量減薄液層厚度及強化液層的流動。
2、分子在液層表面上的自由蒸發：
蒸發速度隨著溫度的升高而上升，但分離因素有時卻隨著溫度的升高而降低，所以，應以被加工物質的熱穩定性為前提，選擇經濟合理的蒸餾溫度。
3、分子從蒸發表面向冷凝面飛射：
蒸氣分子從蒸發面向冷凝面飛射的過程中，可能彼此相互碰撞，也可能和殘存于兩面之間的空氣分子發生碰撞。由于蒸發分子遠重于空氣分子，且大都具有相同的運動方向，所以它們自身碰撞對飛射方向和蒸發速度影響不大。而殘氣分子在兩面間呈雜亂無章的熱運動狀態，故殘氣分子數目的多少是影響飛射方向和蒸發速度的主要因素。
4、分子在冷凝面上冷凝：
只要保證冷熱兩面間有足夠的溫度差（一般為70~100℃），冷凝表面的形式合理且光滑則認為冷凝步驟可以在瞬間完成，所以選擇合理冷凝器的形式相當重要。
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