分析型多肽色譜儀種類有多種。
1、按分離目的可分：化驗室分析型多肽色譜儀和工業分析型多肽色譜儀。
2、按分離原理可分：分析型多肽分配色譜儀、分析型多肽離子色譜儀和分析型多肽凝膠色譜儀。
3、按作用可分：分析型多肽定量色譜儀和分析型多肽定性色譜儀。
4、按進樣自動性可分：自動進樣分析型多肽色譜儀和手動進樣分析型多肽色譜儀。
5、按洗脫方式可分：等度洗脫分析型多肽色譜儀和梯度洗脫分析型多肽色譜儀。
6、按產地可分：國產分析型多肽色譜儀和進口分析型多肽色譜儀。
7、按固定相性質可分：硅膠固定相分析型多肽色譜儀和化學鍵合固定相分析型多肽色譜儀等。