繼發性癲癇的原因很多，許多中樞神經系統疾病或全身疾病都可以引起癲癇。常見致病因素有：
1．先天性疾病：如染色體畸變、先天性腦積水、小頭畸形、胼胝體發育不全、腦皮質發育不全及遺傳性疾病等。
2．產前期和圍生期損傷：如產傷、窒息、顱內出血、早產、宮內發育不良及黃疸等，是小兒繼發性癲癇的常見原因。
3．熱性驚厥后遺：嚴重和持久的熱性驚厥可以導致包括神經元缺失和膠質細胞增生的腦損害，主要在顳葉內側面，尤其在海馬體。
4．顱腦損傷：以開放性損傷、重度損傷、凹陷性骨折、硬腦膜撕裂、外傷后意識障礙、損傷后數周內產生早期癇性發作的病例容易發生后遺癲癇。劉國英指出頂葉損傷最易發生癲癇。
5．顱內感染：如各種細菌、病毒、真菌感染引起的腦炎、腦膜炎、腦膿腫、炎性肉芽腫以及寄生蟲感染引起的腦囊蟲病、腦包蟲病、腦血吸蟲病、腦肺吸蟲病、腦弓形體病、腦旋毛蟲病及腦型瘧疾等。
6．中毒：重金屬、有害氣體、化學物品及藥物中毒均可引起腦損害而導致癲癇發作，如鉛、汞、一氧化碳、乙醇、番木鱉堿、異煙肼中毒等以及全身性疾病，如妊娠高血壓綜合征、尿毒癥等。
7．顱內腫瘤：如腦膠質瘤、腦錯構瘤、腦膜瘤、顱內脂肪瘤、顱咽管瘤、轉移瘤等。
8．腦血管疾病：如腦血管畸形、腦動脈硬化、腦出血、腦缺血、腦梗塞、腦血栓等。
9．營養、代謝性疾病：如佝僂病、低血鈣、胰島素瘤、糖尿病、甲亢、甲狀旁腺功能減退、維生素B6缺乏癥等。
10．其他：如結節性硬化、老年期癡呆也常伴有癲癇。
