SNPs 的二態性，也有利于對其進行基因分型。
對SNP進行基因分型包括三方面的內容：
(1)鑒別基因型所采用的化學反應，常用的技術手段包括：DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應、側翼探針切割反應以及基于這些方法的變通技術；
(2)完成這些化學反應所采用的模式，包括液相反應、固相支持物上進行的反應以及二者皆有的反應。
(3)化學反應結束后，需要應用生物技術系統檢測反應結果。
