衛生部9月23日發布2009年秋冬季甲型H1N1流感疫苗預防接種指導意見，就疫苗的使用、預防接種的實施等給予了明確規定。
指導意見指出，根據目前的資料，疫苗適用人群的年齡為3歲以上人群。我國的甲型H1N1流感疫苗只需接種一針，接種部位是上臂外側三角肌。
中國疾控中心免疫中心主任梁曉峰說，從目前掌握的情況來看，孕婦感染甲型H1N1流感容易造成病死，所以世界衛生組織和美國疾控中心都將孕婦列為高度優先的重點接種人群，但我國目前尚未將孕婦列為接種對象，這主要是因為目前缺乏孕婦接種甲型H1N1流感疫苗的臨床試驗資料，孕婦接種甲型H1N1流感疫苗的風險性不確定。對哺乳期婦女的接種，也應充分權衡利弊后再作決定。
這次甲流疫苗接種由省級財政出資，國家進行補助，先行在北京、上海、廣州、山東等地開展。
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