文章導讀
表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成,還有文章探究過其在急性白血病中的作用,但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在Molecular Cancer (IF=15) 上的文章RNA demethylase ALKBH5 prevents pancreatic cancer progression by posttranscriptional activation of PER1 in an m6A-YTHDF2-dependent manner揭示了去甲基化酶ALKBH5通過調控m6A修飾調節PER1的轉錄后激 活,發揮對胰腺ai抑 制作用。
發表期刊:Molecular Cancer
影響因子:15.302
發表時間:2020.5.19
實驗方法: m6A-seq, RNA-seq,MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP, 雙熒光素酶實驗
文章鏈接:RNA
demethylase ALKBH5 prevents pancreatic cancer progression by
posttranscriptional activation of PER1 in an m6A-YTHDF2-dependent manner
研究內容
1.ALKBH5降低對胰腺ai的指示意義
首先為了探究去甲基化酶ALKBH5在胰腺ai中的表達和臨床意義,作者對42個胰腺ai患者的腫
瘤和臨近組織做了qPCR和免疫染色,發現腫
瘤中ALKBH5的表達明顯降低,mRNA的m6A水平升高。加上對數據庫中177個胰腺ai患者生存率的分析發現
ALKBH5低表達與總生存率的降低具有相關性。這些結果初步顯示了ALKBH5表達對胰腺ai的預測和預后具有指示意義。
2.ALKBH5降低對胰腺ai細胞轉錄組水平的影響
接著,作者對3個過表達ALKBH5的胰腺ai細胞樣品和3個對照胰腺ai細胞樣品進行了RNA-seq(云序提供服務),發現過表達的ALKBH5的細胞中,前15個上調基因包括了
PER1, FOXO1, CDC20,
和CCR5等,GO分析顯示上調的基因富集在細胞周期終止、抗增殖和細胞凋亡等功能,而下調的基因富集在細胞增殖和存活相關功能條目中,KEGG分析顯示富集的通路中含有細胞周期和生長的相關的通路p53信號通路和
PI3K-AKT信號通路。這些轉錄組數據顯示ALKBH5具有抑 制胰腺ai的功能。
3.ALKBH5抑 制胰腺ai細胞增殖、遷移和侵襲
作者通過細胞表型實驗進一步驗證ALKBH5對胰腺ai細胞的影響。通過轉染手段,發現對胰腺ai細胞進行ALKBH5過表達能導致細胞增值降低,而敲降ALKBH5會導致細胞增值速率上升。細胞群落形成實驗和流式細胞儀分析顯示了相同結果。并且過表達ALKBH5抑
制傷口閉合和ai細胞侵襲能力。