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  • 3.單鏈模板的分離

    (1)沉淀M13:在上述M13培養物上清中,加入0.2倍體積的3.5mol/L醋酸銨/20%多聚乙二醇溶液,顛倒混勻數次,置冰浴30分鐘。離心15-30分鐘(11000g)可見白色噬菌體沉淀。小心除去上清液,可將試管倒置并吸去多余液體。

    (2)分離純化模板:向沉淀中加入TE緩沖液100μl,輕輕混勻使沉淀重懸,(以下步驟可在微量離心管中進行)。再加等體積酚/氯仿試劑,旋轉振蕩30秒,離心1分鐘使分層。小心將上層液轉移至另—干凈離心管中。用酚/氯仿重復抽提一次并轉移上層液。

    加等體積氯仿,離心,轉移上層液至潔凈管中,并重復1次。

    加1/10體積3mol/L醋酸鈉(pH7.5)及兩倍體積100%乙醇,混合,置干冰(或-40℃冰箱)中15分鐘,離心10分鐘,除去上清,加冰冷的70%乙醇lml,離心,除去上清,于真空條件短暫干燥。

    加入20μlTris緩沖液溶解DNA沉淀,儲于-20℃待用。

    用于測序的DNA,其A260/A280光密度比值至少應大于1.7。

    [試劑與器材]

    1.試劑

    (1)退火緩沖液:1mol/L Tri-HCl(pH7.6),l00mmol/L MgCl2和160mmol/L DTT。

    (2)通用測序引物:5’-d[CGTAAAACGACGGCCAGT]-3’,在水溶液中(5pmol/μl)。


    (3)T7DNA聚合酶(8ug/μl):在加有甘油的緩沖液中,應儲于-20℃,用時吸取1份后迅速放回。稀釋液可在4℃保存l周。

    (4)酶稀釋緩沖液:20mmol/L Tris-HCl(pH7.5),5mmol/L DTT,100 u g牛血清白蛋白/m1,5%甘油。

    (5)標記用混合物(Labelling Mix):dCTP,dGTP和dTTP各1.375μm,333.5mmol/L NaCl。

    (6)模板:l0μg單鏈M13mpl8DNA在50μ1Tris-EDTA緩沖液中。

    (7)“A”mixshort:dCTP,dGTP和dTTP各840μmol/L,93.5μmol/L dATP,14μmol/L ddATP,40mmol/L Tris-HCl(pH7.6),50mmol/L NaCl

    (8)“G"mixshort;dATP,dCTP和dTTP各840μmol/L,93.5μmol/LdGTP,14μmol/L ddGTP,40mmol/L Tris-HCl(pH7.6),50mmol/LNaCl


    (9)"C"mixshort:dATP,dGTP和dTTP各840μM,93.5μmol/LdCTP,14μmol/L ddCTP,40mmol/L Tris- HCl(pH7.6),50mmol/LNaCl。

    (10)"T/mixshort:dATP,dCTP和dGTP各840μmol/L,93.5μmol/L dTTP,14μmol/L ddTTP,40mmol/L TrisHCl(pH7.6),50mmol/LNaCl。

    (11)終止液:溴酚藍和二甲苯腈藍FF各3%,l0mmol/L EDTA(pH7.5),97.5%去離子甲酰胺。

    (12)標記脫氧核苷酸:[α-32P]dATP,10mci/m1,3000ci/mmol。

    說明:除試劑12購自Amersham公司外,其余上述試劑均包括在Pharmacia Biotech公司的T7SequencingTMKit試劑盒內。

    (13)顯影劑

    (14)定影劑

    2.器材

    恒溫加熱器或恒溫水浴槽;渦旋振蕩器;臺式高速離心機;恒功率電泳儀;測序用電泳槽(附玻板及隔離條)蓋革計數器;可調式加樣器;微量離心管 (Eppendorf管);膠帶;剪刀;手術刀;燒杯(100ml);梨形瓶(100ml);水泵;注射器(50ml);注射器針頭(18號);新華濾紙 (3號)或Whatman濾紙(1號);保鮮膜;凝膠干燥器材;抽氣泵;增感屏;X光膠片;顯影及定影用具。


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