1.概述：反向PCR(reverse PCR)是用反向的互補引物來擴增兩引物以外的未知序列的片段，而常規PCR擴增的是已知序列的兩引物之間DNA片段.實驗時選擇已知序列內部沒有切點的限制性內切酶對該段DNA進行酶切，然后用連接酶使帶有粘性末端的靶序列環化連接，再用一對反向的引物進行PCR，其擴增產物將含有兩引物外未知序列，從而對未知序進行分析研究.
2.反向PCR的操作流程：擴增前先用限制性內切酶酶切樣品DNA，然后用DNA連接酶連接成一個環狀分子，通過反向PCR擴增引物的上游片段和下游片段。
3.選擇多種限制性內切酶的基本準則：是選擇不能在非酶切位點切斷靶DNA的酶。裂解核心區的內切酶使反向PCR只能擴增引物所定模板(依賴于引物)的上游或下游區，而不裂解核心區的酶則使兩側序列都擴增。Southern雜交來確定內切酶用以產生大小適于環化及反向PCR的片段的末端片段。