由于外界環境具有不確定性，因此玉米等作物種子在室外發芽也具有不可控性，因此導致作物種子的發芽率較低，種子沒有得到完全的利用，而使用發芽箱來進行玉米種子室內發芽，是近年來比較熱門的種子研究手段，它通過控制溫度、濕度和光照等條件，為玉米種子室內發芽創造了舒適的條件。
玉米種子只有在適宜的溫度條件下，才能夠正常、良好的發芽，溫度過低會使玉米種子生理作用延緩，而溫度過高又會使玉米種子的生理活動受到抑制而影響發芽，甚至是產生畸形苗，因此要開展玉米種子室內發芽試驗，那么就需要將發芽箱的溫度控制在合適的溫度，而研究表明，玉米種子發芽的最適宜溫度是25℃，因此通常在進行玉米種子發芽試驗的時候，發芽箱的溫度會控制在恒溫25℃，而且發芽箱的精準控制功能能夠保證溫度變幅不超過±1℃，滿足玉米發芽對溫度條件的需求。
其次濕度和光照也十分重要，發芽箱也需要創造這兩個條件，發芽箱內相對濕度會控制在90％以上，而光照是采用24h光照，促進幼苗子葉、初生葉的光合作用。利用發芽箱創造充足的光照條件，不僅有利于抑制發芽過程中霉菌的生長繁殖而且還可以開展正常幼苗的鑒定，區分黃化和白化的不正常幼苗，因此可以說，發芽箱是開展玉米發芽試驗的理想設備，同時也是種子檢驗中重要的儀器設備。發芽箱的應用，能夠減少發芽試驗誤差，提高發芽試驗結果的準確性，對于控制劣種下地、保苗增產、保護使用者利益。