實驗方法原理 根據本方案制備的哺乳動物 DNA 約 20~50 kb,適于作 PCR 反應的模板。DNA 產量在 0.5 到 3.0 μg/mg 組織之間變化,或者是 5~15 μg/300μl 全血。
實驗材料 無 DNase 的 RNase蛋白酶 K哺乳動物組織或全血
試劑、試劑盒 細胞裂解緩沖液乙醇異丙醇醋酸鉀溶液紅細胞裂解緩沖液TE
儀器、耗材 連有真空管的抽吸裝置微量離心研棒水浴
實驗步驟
一、材料
1. 緩沖液及溶液
細胞裂解緩沖液(10 mmol/L Tris-Cl (pH 8.0),1 mmol/L EDTA ( pH 8.0),0.1%(m/V) SDS)
乙醇
異丙醇
醋酸鉀溶液(60 ml 的 5 mol/L 醋酸鉀,11.5 ml 冰醋酸,28.5 ml 水)
紅細胞裂解緩沖液(20 mmol/L Tris-Cl (pH 7.6)
TE ( pH 7.6)
2. 酶及緩沖液
無 DNase 的 RNase ( 4 mg/ml)
蛋白酶 K ( 20 mg/ml)
3. 專用設備
連有真空管的抽吸裝置
微量離心研棒
預先調到 55℃ 或 65℃ 的水浴
4. 細胞和組織
哺乳動物組織或全血
二、方法
1. 準備用于分離 DNA 的組織或全血
(1) 組織
① 切下 10~20 mg 組織。
② 用剃刀或解剖刀切碎組織或者將組織冷凍于液氮中,用在液氮中預冷的研缽研磨成粉。
(2) 血液
① 在兩個微量離心管中分別轉移 300 μl 全血樣品。每管中加入 900 μl 紅細胞裂解緩沖液,蓋上蓋子,顛倒混勻。溶液于室溫下放置 10 min, 中間顛倒混勻幾次。
② 室溫下用最大轉速離心 20 s。
③ 每管保留 20 μl 上清,棄去其他部分。
④ 用剩余的少量上清重懸白細胞沉淀。將兩管中的沉淀合成一管。
2. 將切碎的組織或者重懸的白細胞沉淀轉移到加有 600 μl 冰冷的細胞裂解緩沖液的離心管中。用微量研棒迅速研磨 30~50 下,混勻懸濁液。
3. (可選擇的)向裂解產物中加入 3 μl 蛋白酶 K, 以增加基因組 DNA 的產量。消化液置于 55℃ 放置 3 h 以上,但不要超過 16 h。
4. 消化液降至室溫,然后加入 3 μl 4 mg/ml 的無 DNase 的 RNase。37℃ 放置 15~60 min。
5. 將樣品降至室溫。加入 200 μl 醋酸鉀溶液,劇烈振蕩 20s 使其充分混合。
6. 用最高轉速 4℃ 離心 3 min, 使蛋白/SDS 復合物沉淀出來。
7. 將上清轉移到加有 600 μl 異丙醇的新離心管中。充分混合,然后用最大轉速室溫下離心 1 min 收集 DNA 沉淀。
8. 吸去上清,加入 600 μl 70% 的乙醇。顛倒管子數次,用最大轉速室溫下離心 1 min。
9. 小心吸去上情,空氣中干燥 DNA 沉淀 15 min。
10. 將 DNA 沉淀溶解于 100 μl TE ( pH 7.6)。
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