（一）疑似診斷 1、在皮下觸到彈力性硬的圓或橢圓形結節，約0.5—1cm直徑大小。 2、無其他原因可查的癲癇發作，若在本病流行區尤其有償絳蟲史或查體有典型的皮肌囊尾蚴病者，應疑似腦囊尾蚴病。
（二）臨床診斷與實驗診斷 1、凡疑似病例經IHA、ELISA等方法檢查陽性，可臨床診斷。 2、CT或MRI檢查可幫助做出腦囊尾蚴病的臨床診斷。 3、皮下結節活檢或腦手術病理組織檢查證實者，可為確定診斷的依據。
（三）鑒別診斷 腦囊尾蚴病應與原發性癲癇、顱內腫瘤、結核性腦膜炎、隱球菌性腦膜炎等鑒別，影像性檢查和血清免疫學檢查可提供鑒別依據。