我國地大物博，有著非常多的林木種質資源，這些都是品種選育的重要材料，但是實際上目前對它們的利用程度卻并不高，這也導致種質資源開發利用和一些生態經濟樹種的良種選育工作嚴重滯后。而為了更好的開發利用這些林木種質資源，采用國家林木種質資源庫對這些林木種質資源進行調查和保護是必不可少的。
國家林木種質資源庫主要用于種子類型的林木種質資源的保存，它的應用，可以為調查人員開展林木種質資源普查工作解決后顧之后，能夠更好的開展種質資源保存和管理工作。國家林木種質資源庫利用先進的技術手段可以使保存其中的林木種質資源長期保持優良的特性，另外，我們還另外研發了管理軟件，能幫助育種人員更好的管理庫體，更加有效的開展林木種質資源的利用工作，為制定林木種質資源收集保存與開發利用提供了支持。
總的來說，它的作用主要有兩點：1.可以實現各種種質資源的科學貯藏，可以根據種質的貯藏要求做到安全儲藏的目的；2.可以為用戶提供快捷的種質資源信息查詢服務，方便用戶查詢和調取種質資源信息。
采用國家林木種質資源庫助力品種優育，選育出優質多樣的林木和花卉新品種，既滿足了人們對木材、果品、花卉、藥材等方面的多樣化需求，還可以及時搶救瀕臨滅絕的具有潛在應用和育種價值的野生林木種質資源，發掘培育林木新品種，帶動農民增收致富，對林業、苗木產業升級發展，美化居民生活、營造良好生態環境等發揮了極其重要的作用。