蛋白質亞細胞定位及其動態變化過程對于蛋白質功能至關重要。隨著鳥槍法蛋白質組學的發展，通過亞細胞分離及質譜技術同時測定數千個蛋白質穩態定位的“蛋白質組學顯微鏡(proteomic microscope)”出現了。然而，表征因擾動導致的亞細胞定位變化的工具卻一直局限在光學顯微鏡，每次僅能成像一個或幾個蛋白。
德國馬克思·普朗克生物化學研究所Borner實驗室提供了一套獲取“動態細胞器分布圖譜(Dynamic Organellar Maps)”的方法。這是一種靈敏的，類似于蛋白質組學顯微鏡的方法，可以分析蛋白質亞細胞定位的變化。這套簡單、快速、可靠的方法結合了差速離心亞細胞分離法，定量質譜，以及一套標準化的生物信息處理流程。儀器方面僅需質譜和超速離心機。所有下游分析都由免費軟件完成，無需蛋白質組學或生物信息學專業知識。
該法可用于各種均相或原代細胞培養，只用極少量（1毫克）蛋白質作原料，且適用于各種生物環境。該方法成功應用的案例包括闡明了一種由遺傳紊亂影響的蛋白質轉運致病機制，以及定量而詳細地表征了在生長因子刺激下蛋白質在細胞中的運動方式。簡而言之，該法提供了一種在系統范圍內表征自然或擾動條件下的蛋白質的亞細胞動態的有力而全面的探索工具。
這套綜合實驗室和數據分析的方案為新手用戶提供了充足信息，讓他們可以將動態細胞器分布圖譜應用于自己的系統。
相關文章在線發表在Current Protocols（DOI: 10.1002/cpcb.81）上。