基因敲除是一種遺傳工程技術，是指通過一定的途徑使機體特定的基因失活或缺失的技術。基因敲除針對某個序列已知但功能未知的序列，改變生物的遺傳基因，令特定的基因功能喪失作用，從而使部分功能被屏蔽，并可進一步對生物體造成影響，進而推測出該基因的生物學功能。
基因敲除技術克服了隨機整合的盲目性和偶然性，是一種理想的修飾、改造生物遺傳物質的方法。這項技術的誕生可以說是分子生物學技術上繼轉基因技術后的又一革命。尤其是條件性、誘導性基因打靶系統的建立，使得對基因靶位時間和空間上的操作更加明確、效果更加精確、可靠，基因敲除技術的發展將為發育生物學、分子遺傳學、免疫學及醫學等學科提供了一個全新的、強有力的研究。