應抓住抗結核治療和降低顱高壓兩個重點環節。
一、一般療法
應臥床休息，細心護理，對昏迷患者可予鼻飼或胃腸外營養，以保證足夠熱量，應經常變換體位，以防止壓瘡和墜積性肺炎。做好眼睛、口腔、皮膚的清潔護理。
二、抗結核治療
聯合應用易透過血腦屏障的抗結核殺菌藥物，分階段治療。
（1）強化治療階段聯合使用INH、RFP、PZA及SM。療程3～4個月。
（2）鞏固治療階段繼用INH，RFP或EMB。RFP或EMB9～12個月。抗結核藥物總療程不少于12個月，或待腦脊液恢復正常后繼續治療6個月。早期患者可采用9個月短程治療方案（3HRZS/6HR）有效。
三、降低顱高壓
由于室管膜炎癥的刺激，腦脊液分泌增多，壓力增高；加之腦底大量炎性滲出物及肉芽充填后，使腦脊液循環通路受阻而產生各種類型腦積水。最早于10天即可出現，故應及時控制顱內壓，措施如下：
（1）脫水劑常用20%甘露醇。
（2）利尿劑乙酰唑胺一般于停用甘露醇前1～2天加用該藥。
（3）側腦室穿刺引流適用于急性腦積水而其他降顱壓措施無效或疑有腦疝形成時。引流量根據腦積水嚴重程度而定，一般每日50～200ml，持續引流時間為1～3周。有室管膜炎時可予側腦室內注藥。特別注意防止繼發感染。
（4）腰穿減壓及鞘內注藥適應證為：①顱內壓較高，應用激素及甘露醇效果不明顯，但不急需作側腦室引流或沒有作側腦室引流的條件者；②腦膜炎癥控制不好以致顱內壓難于控制者；③腦脊液蛋白量>3.0g/L以上。方法為：根據顱內壓情況，適當放出一定量腦脊液以減輕顱內壓。
（5）分流手術若由于腦底腦膜粘連梗阻發生梗阻性腦積水時，經側腦室引流等難以奏效，而腦脊液檢查已恢復正常，為徹底解決顱高壓問題，可考慮作側腦室小腦延髓池分流術。
四、糖皮質激素
能抑制炎癥滲出從而降低顱內壓，可減輕中毒癥狀及腦膜刺激癥狀，有利于腦脊液循環，并可減少粘連，從而減輕或防止腦積水的發生。是抗結核藥物有效的輔助療法，早期使用效果好。一般使用潑尼松。
五、對癥治療
1、驚厥的處理
及時控制驚厥發作，并防止再發。
（1）地西泮優點：見效迅速（1～3分鐘內見效），對85%～90%發作有效，缺點：維持療效短暫（1/2～1小時），特異性體質可抑制呼吸。
（2）10%水合氯醛保留灌腸，可與地西泮交替使用。
（3）苯巴比妥鈉肌注或靜滴，肌注20～30分鐘、靜注5～10分鐘見效。
（4）地西泮+苯巴比妥鈉注意呼吸抑制。
（5）其他勞拉西泮、氯硝西泮、苯妥英鈉、丙戊酸鈉。
2、水、電解質紊亂的處理
（1）稀釋性低鈉血癥由于丘腦下部視上核和室旁核受結核炎癥滲出物刺激，使垂體分泌抗利尿激素增多，導致遠端腎小管回吸收水增加，造成稀釋性低鈉血癥。如水潴留過多，可致水中毒，出現尿少、頭痛、頻繁嘔吐、反復驚厥甚至昏迷。治療宜用3%氯化鈉液靜滴，每次6～12ml/kg，可提高血鈉5～l0mmol/L，同時控制入水量。
（2）腦性失鹽綜合征結腦患兒可因間腦或中腦發生損害，調節醛固酮的中樞失靈，使醛固酮分泌減少；或因促尿鈉排泄激素過多，大量Na’由腎排出，同時帶出大量水分，造成腦性失鹽綜合征。應檢測血鈉、尿鈉，以便及時發現，可用2：1等張含鈉液補充部分失去的體液后，酌情補以3%氯化鈉液以提高血鈉濃度。
（3）低鉀血癥宜用含0.2%氯化鉀的等張溶液靜滴，或口服補鉀。
六、隨訪觀察
復發病例全部發生在停藥后4年內，絕大多數在2～3年內。停藥后隨訪觀察至少3～5年，凡臨床癥狀消失，腦脊液正常，療程結束后2年無復發者，方可認為治愈。