威靈仙的根莖呈柱狀，長1.5～250px，直徑0.3～37.5px；表面淡棕黃色；頂端殘留莖基；質較堅韌，斷面纖維性；下側著生多數細根。根呈細長圓柱形，稍彎曲，長7～375px，直徑0.1～7.5px；表面黑褐色，有細縱紋，有的皮部脫落，露出黃白色木部；質硬脆，易折斷，斷面皮部較廣，木部淡黃色，略呈方形，皮部與木部間常有裂隙。氣微，味淡。
