1．抗原抗體濃度的比例 當抗原抗體比例不適合時，均不能出現明顯可見的沉淀線。所以除了應用高效價的血清外，每份待測樣品均可做幾個不同的稀釋度來進行檢查。
2．特異性對照鑒定 為了排除假陽性反應，則在待檢抗原孔的鄰近并列一陽性抗原孔，若待檢樣品中的抗原與抗體所形成的沉淀線和陽性抗原抗體沉淀線完全融合時，則待檢樣品中所含的抗原為特異性抗原。
3．適當的電滲作用在對流免疫電泳中是必要的。當瓊脂質量差時，電滲作用太大，而使血清中的其它蛋白成分也泳向負極，造成非特異性反應。在某些情況，瓊脂糖由于缺乏電滲作用而不能用于對流免疫電泳。
4．當抗原抗體在同一介質中帶同樣電荷或遷徙相近時，則電泳時兩者向著一個方向泳動。故不能用對流免疫電泳來檢查。