可引起病毒性心肌炎的病毒常見的為腺病毒（特別是血清型2及5）和腸道病毒（柯薩奇病毒A及B組、埃可病毒、脊髓灰質炎病毒），其中以柯薩奇病毒B組（CVB）最為常見。其他可引起病毒性心肌炎的病毒包括：單純皰疹病毒、水痘及帶狀皰疹病毒、巨細胞包涵體病毒、風疹病毒、流行性腮腺炎病毒、丙型肝炎病毒、登革熱病毒、黃熱病病毒、狂犬病病毒、呼吸道腸道病毒等。
