維生素B6包括6種可以通過酶可互相轉換的吡哆醇(pyridoxine，PN)、吡哆胺(pyridoxamine，PM)、吡哆醛(pyridoxal，PA或PL)和它們各自的5-磷酸化物。吡哆醛5-磷酸鹽是這一組中的重要部分，在脫羧作用及氨基轉移作用中,作為酶系統的輔酶參與體內氨基酸、蛋白、脂類、核酸及糖原的代謝。如果缺乏可致抽搐及末梢神經疾患。因此，維生素B6缺乏可致生化及生理方面的異常。PL及PM磷酸化后變化輔酶，磷酸吡哆醛(PLP)及磷酸吡哆胺(PMP)。吡哆醇為人工合成的產品，在植物中也有；在動物體內，多以輔酶PLP及PMP的形式存在。因為5-磷酸吡哆醛是氨基酸代謝中許多酶的輔酶，故蛋白質代謝需要維生素B6的參與，當維生素B6缺乏時，可致機體免疫力下降、發生貧血等。
維生素B6依賴癥是伴性隱性遺傳疾病，影響各種維生素B6脫輔基酶蛋白,并能引起驚厥、智力缺陷、胱硫醚尿、鐵胚細胞(鐵過載)性貧血、蕁麻疹、哮喘以及黃尿酸尿。由于在神經系統中，PLP與谷氨酸脫氨酶的輔基酶蛋白不能合成，使γ氨基丁酸(GABA)合成減少，GABA是中樞神經系統抑制性神經遞質，其腦內濃度降低，造成驚厥閾降低，臨床上出現驚厥。
5-磷酸吡哆醛是血紅蛋白合成的第一步反應(甘氨酸與琥珀酸結合生成δ-氨基乙酰丙酸)過程中不可缺少的輔酶，該疾病可能由于δ-氨基乙酰丙酸合成缺陷，從而導致血紅蛋白合成障礙。臨床可出現小細胞低色素性貧血。