1. 工業潔凈室和生物潔凈室適用領域的區別 ：
工業潔凈室適用于精細機械工業、電子工業（半導體、集成電路等）宇航工業、高純度化學工業、原子能工業、光磁產品工業（光盤、膠片、磁帶消費） LCD（液晶玻璃）、電腦硬盤、電腦磁頭消費等多行業。
生物潔凈室適用于制藥工業、醫院（手術室、無菌病房）、食品、化裝品、飲料產品消費、動物實驗室、理化檢驗室、血站等。
2. 工業潔凈室和生物潔凈室研究對象的區別：
工業潔凈室主要研究灰塵、粒子（只有一次污染）。
生物潔凈室主要研究微生物、病jun等活的粒子（會誘發二次污染）。
3. 工業潔凈室和生物潔凈室控制目標的區別：
工業潔凈室主要目標是控制有害粒徑粒子濃度。
生物潔凈室主要目標是控制微生物的產生、繁殖和傳播，同時控制其代謝物。
4. 工業潔凈室和生物潔凈室對生產工藝的危害區別：
工業潔凈室內關鍵部位只要一點灰塵就能造成對產品的較大危害。
生物潔凈室內有害的微生物要達到一定的濃度以后才能夠造成危害。
5. 進入工業潔凈室和生物潔凈室前對人、物要求的區別：
工業潔凈室進入前人員要換鞋、更衣、吹淋。物品要進行清洗、擦拭。人員和物品要進行分流，潔污也需要分流。
生物潔凈室進入前人員要要換鞋、更衣、淋浴、滅jun。物品要進行清洗、擦拭、滅菌。空氣送入也要進行過濾、滅菌。人員和物品要進行分流，潔污也需要分流。