以往研究基因表達差異的方法主要有： 蛋白質雙向電泳、cDNA 減法雜交和mRNA 差示技術( 簡稱DD2PCR )。蛋白質雙向電泳只能粗略地比較兩種細胞內產生的蛋白質， 不能直接從基因水平分析鑒定， 因而很難推廣； cDNA 減法雜交需建立cDNA 文庫， 通過兩次雜交分離去除雙鏈分子， 再將余下的單鏈分子同文庫進行雜交， 這種方法不僅技術復雜、費時， 而且重復性差；
