布魯克推出全新timsTOF?Pro捕集離子淌度質譜

　　分析測試百科網訊 在近日召開的第十六屆人類蛋白質組學年度世界大會（HUPO）上，布魯克推出了基于平行累積連續碎裂（Parallel Accumulation Serial Fragmentation，PASEF）技術的timsTOF Pro質譜系統。憑借其專有的捕集離子淌度質譜（TIMS）技術，可以更快、更靈敏、穩定地完成鳥槍法蛋白質組學的任務，即在單次進樣中出色地完成對多肽和蛋白質的鑒定工作。

　　全新timsTOF Pro質譜特別有利于定量蛋白質組學工作流程。目前這款創新的TIMS-powered的四極桿飛行時間質譜儀（QTOF-MS）由MaxQuant/Perseus和PEAKS Studio蛋白質組學分析軟件支持。

timsTOF Pro捕集離子淌度質譜

　　獨特的前端TIMS分析器針對更高速度的鳥槍法蛋白質組學進行了優化，能從較小樣品量中獲得突出的鑒定效果。其獨特的雙TIMS排列允許離子在第一個TIMS部分中進行累積，然后在第二個TIMS中根據淌度進行分離，經過分離后的離子繼續用于MS/MS碎裂。隨后重復該步驟，在該過程中，當第二個TIMS進行分離時，第一個TIMS也同時在平行的累積離子，這樣可以實現近乎100％的離子利用率。使用這種PASEF技術可以為納升LCMS分析酶解蛋白質混合物的工作提供優異的穩定性。

　　 PASEF技術代表了性能的改進，因為它提為鳥槍法蛋白質組學提供了更高的靈敏度和更快的速度，并且不損失質量分辨率。在鳥槍法蛋白質組中經常使用的基于傅立葉變換的質譜，存在著提高掃描速度會降低質譜分辨率的問題。而現在PASEF技術解決了這個問題，憑借近100％的離子利用率，可以在母離子和子離子掃描過程中，在保持質譜超高分辨率的同時獲得更高的靈敏度。這種PASEF技術使timsTOF Pro成為科學家們的得力工具。可幫助他們對復雜樣品的分子機制進行更深入的研究、提高發現低豐度生物學重要蛋白質的可能性；在轉化醫學、臨床蛋白質組學研究中進行大批量驗證和縱向研究。

　　定量蛋白質組學是蛋白質組學研究的一個關鍵領域。與傳統的基于門控技術、時間串聯技術和傅立葉變換技術的質譜相比，雙TIMS-powered的PASEF技術具備顯著的優勢。新的timsTOF Pro在低上樣量（100-200ng）的情況下超過四個數量級的動態范圍。使其適用于小細胞群體的蛋白質組學和生物研究和臨床研究中經常遇到的低豐度樣品。

　　德國 Max Planck Institute of Biochemistry的蛋白質組學和信號轉導系主任Matthias Mann 說：“我的實驗室與布魯克合作開發PASEF技術，我們很高興看到timsTOF Pro實現了我們最初設想的鳥槍法蛋白質組學的潛力。這種新技術有可能革新蛋白質組學的幾個領域：在需要運行大批量樣品中確保速度和穩定性的臨床研究；需要增加靈敏度的應用，例如磷酸化多肽的富集實驗或數量有限的待分析細胞；使用同位素標簽的定量實驗，由于附加的離子淌度至少能部分去除由共洗脫峰帶來的污染物，從而避免了由污染物帶來的同位素抑制效應和由此產生的誤差。我們同時也對該技術進一步發展的潛力感到非常興奮。”

　　布魯克道爾頓Omics解決方案副總裁Gary Kruppa說：“蛋白質組學研究人員總是希望提高速度、靈敏度和定量能力，同時保持高分辨率、精確質量和真實同位素峰型的優勢，從而可以深入地研究蛋白質組學。使用PASEF技術，科學家們現在無需權衡分辨率、掃描速度和靈敏度，他們可以通過TIMS前體離子選擇獲得高靈敏度、高掃描速度和無與倫比的特異性三重效果。這些特點的結合超出了非TIMS質譜儀的性能范圍，為發現低豐度蛋白質提供了令人興奮的可能性。”

　　Max Planck Institute of Biochemistry的計算系統生物化學小組組長Juergen Cox評論說：“布魯克決定采用開放文件格式，以便我們可以直接使用原始數據，這將有利于使用MaxQuant和Perseus的蛋白質組學研究人員。 我們對現有的數據非常滿意，并期待與布魯克合作支持共同的客戶，通過最先進的軟件對于在基于PASEF技術的timsTOF Pro質譜儀上采集的數據進行分析和統計驗證。”