本病病因和發病機制不明，目前認為其發病與感染和免疫功能紊亂有關。特別是柯薩奇病毒與皮肌炎發病有關。感染引起淋巴細胞釋放細胞因子，損害肌纖維，同時肌肉蛋白變性而具有了抗原性，產生的自身抗原抗體反應可能起一定作用。一般認為，本病為細胞介導的免疫失調所引起的骨骼肌疾病。皮肌炎患兒HLA-B8和DR3明顯增加，但與家庭遺傳的關系尚不明確。
1.自身免疫
根據自身免疫性疾病學說，本病臨床上與SLE及硬皮病有許多共同之處，亦可測出某些器官非特異性自身抗體，如RF（類風濕因子）、ANA（抗核抗體）等，并發現患者血清中有抗橫紋肌、Mi、PM-1和JO-1抗體等。半數患者抗肌凝蛋白陽性，腫瘤組織抗原與肌纖維、腱鞘、血管等有交叉抗原性，與產生的抗體發生抗原抗體反應而發病。近年來認為該病的發病機制是對橫紋肌的一種細胞免疫反應。
2.感染
有人報道對本病患者的皮膚、肌肉進行電鏡檢查，發現黏病毒樣結構，其后有人分離出柯薩奇病毒A9型及柯薩奇病毒B。此外尚有細菌、弓形體感染學說。也有人認為本病系某種感染原引起橫紋肌及其間結締組織的變態反應。
3.家庭遺傳
目前尚沒有完全確定JDM的引發與其相關。組織相容性白細胞抗原（HLA）-DQA1*0501和腫瘤壞死因子（TNF）-d-308A與JDM發病有關，后者還與病程、鈣質沉著相關。
4.環境因素
有研究資料表明，JDM的發生與季節、地理位置有關。另外，疫苗、藥物及骨髓移植等亦可誘發JDM。
