圖 3 為三個雜質的推斷結構，圖 4 為三個雜質測得的同位素分布和推斷結構同位素分布的比較，圖5 為藥物中間體和三個雜質的提取離子色譜圖。兩個含氯雜質的信號強度是未修飾中間體的0.1％。由于儀器靈敏度和信噪比高，四個化合物可在一次數據相關的二級質譜實驗被檢測到。動態排除是數據相關采集的又一個特點，低含量成分即使在和高強度成分共同洗脫時，也能夠采集其二級質譜數據，這種功能適合低含量雜質分析的要求。
圖 3. 推斷三個雜質的化學結構為：（a）羥化氯雜質（b）二氫雜質和（c）二氯雜質
圖4. 三個雜質（a）羥化氯雜質（b）二氫雜質和（c）二氯雜質的加氫離子的實驗和理論同位素分布比較圖。左面為實驗得到的全掃描同位素分布圖，右面為根據給定的元素組成用XcaliburTM 軟件中的Isotope Viewer算出的理論同位素分布圖。
圖 5. 藥物中間體和三個雜質的提取離子色譜圖，雜質以相對峰面積計算。
如果沒有動態排除功能，就采集不到二氫雜質的二級質譜數據，因為與二氫雜質共同洗脫的未修飾中間體的強度更高。在二級質譜數據掃描中，排除列表中包括了m/z 391,392, 和393 的離子，以避免背景離子的二級質譜分析。由于使用數據相關采集數據，就不需要在方法中輸入指定二級質譜掃描的母離子質量數。這樣就避免了先進行全掃描實驗，然后手動查找二級質譜掃描需要的母離子質量數。對于低濃度成分分析，這個過程費時且造成實驗失誤。圖6 中，在與碎裂和機理模塊預測結果進行比較前后，Mass Frontier 譜圖管理窗口可以顯示采集到的藥物中間體的二級質譜數據。特別是輸入藥物中間體化學結構后，軟件就使用已知的單分子離解反應模式來預測可能生成的二級質譜碎片離子。然后這些理論預測的二級質譜碎片離子與實驗數據進行匹配分析。圖6 為程序給出的所有的主要二級質譜碎片峰，證明了碎裂和機理算法對給定化學結構二級質譜預測的有效性。
圖 6：（a）藥物中間體實驗得到的二級質譜圖。（b）與理論預測的碎片離子相匹配，其中由Mass Frontier 預測的碎片離子在譜圖上以紅色標記。